Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox13F6YCR7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox13F6YCR7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms