Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cpb1B2RS76 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpb1B2RS76 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms