Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a3A2ACT7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms