Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdc27A2A6Q5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms