Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PnckQ9QYK9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PnckQ9QYK9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PnckQ9QYK9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PnckQ9QYK9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PnckQ9QYK9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PnckQ9QYK9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PnckQ9QYK9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PnckQ9QYK9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PnckQ9QYK9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PnckQ9QYK9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PnckQ9QYK9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms