Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Edf1Q9JMG1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Edf1Q9JMG1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms