Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco4Q9JIS3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms