Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt34Q9D646 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt34Q9D646 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms