Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tsnaxip1Q99P25 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsnaxip1Q99P25 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms