Protein–RNA interactions for Protein: Q91VN6

Ddx41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx41Q91VN6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx41Q91VN6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx41Q91VN6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx41Q91VN6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx41Q91VN6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx41Q91VN6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx41Q91VN6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx41Q91VN6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx41Q91VN6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Ddx41Q91VN6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Ddx41Q91VN6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx41Q91VN6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx41Q91VN6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx41Q91VN6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx41Q91VN6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx41Q91VN6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx41Q91VN6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx41Q91VN6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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