Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Smg8Q8VE18 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Smg8Q8VE18 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Smg8Q8VE18 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Smg8Q8VE18 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms