Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl3Q8CD19 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms