Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot1Q6ZQ08 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot1Q6ZQ08 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms