Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med16Q6PGF3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms