Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Knl1Q66JQ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms