Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic3Q62521 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic3Q62521 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic3Q62521 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic3Q62521 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms