Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhocQ62159 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhocQ62159 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhocQ62159 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhocQ62159 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhocQ62159 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhocQ62159 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhocQ62159 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms