Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228bQ497Q6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms