Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZAS0

Slc9a2, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a2Q3ZAS0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc9a2Q3ZAS0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc9a2Q3ZAS0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms