Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacs2Q3V3Q7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacs2Q3V3Q7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacs2Q3V3Q7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacs2Q3V3Q7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacs2Q3V3Q7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacs2Q3V3Q7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacs2Q3V3Q7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacs2Q3V3Q7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacs2Q3V3Q7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacs2Q3V3Q7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacs2Q3V3Q7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacs2Q3V3Q7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacs2Q3V3Q7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacs2Q3V3Q7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacs2Q3V3Q7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms