Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
4930567H17RikQ3V0K5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
4930567H17RikQ3V0K5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms