Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain3Q3URJ8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms