Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
rp9P97762 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
rp9P97762 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
rp9P97762 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
rp9P97762 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
rp9P97762 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
rp9P97762 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
rp9P97762 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
rp9P97762 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
rp9P97762 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
rp9P97762 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
rp9P97762 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
rp9P97762 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
rp9P97762 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
rp9P97762 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
rp9P97762 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
rp9P97762 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
rp9P97762 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
rp9P97762 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
rp9P97762 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
rp9P97762 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
rp9P97762 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
rp9P97762 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
rp9P97762 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
rp9P97762 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
rp9P97762 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
rp9P97762 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
rp9P97762 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
rp9P97762 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
rp9P97762 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
rp9P97762 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
rp9P97762 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
rp9P97762 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
rp9P97762 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
rp9P97762 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
rp9P97762 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
rp9P97762 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
rp9P97762 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
rp9P97762 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
rp9P97762 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
rp9P97762 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
rp9P97762 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
rp9P97762 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
rp9P97762 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
rp9P97762 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
rp9P97762 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
rp9P97762 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
rp9P97762 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
rp9P97762 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
rp9P97762 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
rp9P97762 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 426.7 ms