Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nedd4P46935 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms