Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
InaP46660 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
InaP46660 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
InaP46660 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
InaP46660 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
InaP46660 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
InaP46660 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
InaP46660 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
InaP46660 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
InaP46660 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
InaP46660 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
InaP46660 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
InaP46660 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
InaP46660 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
InaP46660 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
InaP46660 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
InaP46660 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
InaP46660 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
InaP46660 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
InaP46660 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
InaP46660 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
InaP46660 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
InaP46660 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
InaP46660 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
InaP46660 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
InaP46660 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
InaP46660 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
InaP46660 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
InaP46660 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
InaP46660 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
InaP46660 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
InaP46660 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
InaP46660 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
InaP46660 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
InaP46660 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
InaP46660 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
InaP46660 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
InaP46660 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
InaP46660 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
InaP46660 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
InaP46660 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
InaP46660 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
InaP46660 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
InaP46660 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
InaP46660 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
InaP46660 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
InaP46660 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms