Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lama1P19137 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lama1P19137 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lama1P19137 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lama1P19137 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lama1P19137 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lama1P19137 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lama1P19137 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lama1P19137 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lama1P19137 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lama1P19137 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lama1P19137 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lama1P19137 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lama1P19137 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lama1P19137 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms