Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18525 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18525 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18525 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18525 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18525 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18525 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18525 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18525 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P18525 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18525 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18525 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18525 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18525 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18525 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18525 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18525 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18525 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18525 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18525 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18525 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18525 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18525 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18525 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P18525 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18525 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18525 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18525 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18525 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18525 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18525 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms