Protein–RNA interactions for Protein: P12023

App, Amyloid-beta A4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AppP12023 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AppP12023 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AppP12023 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AppP12023 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AppP12023 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AppP12023 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AppP12023 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AppP12023 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AppP12023 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AppP12023 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AppP12023 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AppP12023 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AppP12023 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AppP12023 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AppP12023 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AppP12023 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AppP12023 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AppP12023 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AppP12023 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AppP12023 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AppP12023 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AppP12023 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AppP12023 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AppP12023 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AppP12023 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AppP12023 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AppP12023 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AppP12023 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AppP12023 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AppP12023 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AppP12023 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AppP12023 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AppP12023 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AppP12023 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AppP12023 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AppP12023 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AppP12023 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AppP12023 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AppP12023 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AppP12023 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AppP12023 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AppP12023 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AppP12023 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AppP12023 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AppP12023 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AppP12023 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AppP12023 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AppP12023 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AppP12023 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AppP12023 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AppP12023 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AppP12023 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AppP12023 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AppP12023 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AppP12023 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AppP12023 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AppP12023 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AppP12023 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AppP12023 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AppP12023 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AppP12023 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AppP12023 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AppP12023 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AppP12023 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AppP12023 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AppP12023 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AppP12023 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AppP12023 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AppP12023 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AppP12023 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AppP12023 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AppP12023 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AppP12023 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AppP12023 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AppP12023 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AppP12023 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AppP12023 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AppP12023 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AppP12023 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AppP12023 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AppP12023 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AppP12023 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AppP12023 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AppP12023 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AppP12023 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms