Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lamc1P02468 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lamc1P02468 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamc1P02468 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms