Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chil3O35744 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chil3O35744 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chil3O35744 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms