Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf5O35445 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms