Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mfsd4b4J3QNS5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms