Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms