Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r194J3JS27 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r194J3JS27 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms