Protein–RNA interactions for Protein: E9PVP9

Gm4884, Predicted gene 4884, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4884E9PVP9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4884E9PVP9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm4884E9PVP9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms