Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt2E9PUL5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt2E9PUL5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt2E9PUL5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt2E9PUL5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt2E9PUL5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt2E9PUL5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt2E9PUL5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt2E9PUL5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt2E9PUL5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt2E9PUL5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt2E9PUL5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt2E9PUL5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms