Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf1B2RRD7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms