Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a3A2ACT7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a3A2ACT7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms