Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc3Q9QZC1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc3Q9QZC1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc3Q9QZC1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc3Q9QZC1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc3Q9QZC1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc3Q9QZC1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc3Q9QZC1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc3Q9QZC1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms