Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms