Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PnkpQ9JLV6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkpQ9JLV6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.7 ms