Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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