Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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