Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Subh2bvQ9D9Z7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms