Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc3Q9D6Y1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc3Q9D6Y1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms