Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkrip1Q9CWV6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkrip1Q9CWV6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms