Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dkk4Q8VEJ3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms