Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Smg8Q8VE18 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Smg8Q8VE18 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg8Q8VE18 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg8Q8VE18 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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