Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atad2Q8CDM1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad2Q8CDM1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms