Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snapc4Q8BP86 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snapc4Q8BP86 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms